A Resident Evil univerzumában számos különböző történetszál fut össze, melyeket a Requiem epizód igyekszik egyesíteni. A játékok közötti idővonal gazdag fordulatokban, kezdve az 1960-as években felfedezett vírus eredetével, amelyet a tudósok az emberiség evolúciójának gyorsítására akartak felhasználni.
Kiemelt szerepet kap az Umbrella Corporation megalakulása és a különböző vírustörzsek, köztük a T- és G-vírus története, amelyek embereken és a város egésze ellen keltettek pusztítást. A karakterek közötti kapcsolatok is meghatározóak: Wesker árulása, Leon és Jill küzdelmei, valamint az olyan mellékszereplők, mint Alyssa Ashcroft, története is feltárul.
A történet során felmerülnek kérdések az emberi beavatkozás következményeiről, a tudomány etikájáról és arról, hogy hol húzódik a határ az evolúció, valamint a pusztítás között. A különböző szervezetek, mint a DSO, BSAA és az Umbrella, befolyása erőteljesen végigkíséri az eseményeket, valamint új frakciók is színesítik a szövevényes világot.
Végül megjelennek újabb fenyegetések, például a Connections nevű bűnszervezet vagy a mold nevű gomba, amelyek tovább bonyolítják a már amúgy is összetett történetet. A Requiem középpontjában régi és új kérdések, titkok és rejtélyek kerülnek előtérbe, melyek között a túlélők sorsa, a vírus hosszú távú hatásai, valamint Leon személyes hajszája is helyet kap.
