Pokemon Legends ZA új fejezetet nyit a széria történetében: először vezetik be a valós idejű harcrendszert, amely merőben átalakítja az ismert játékmenetet. Rengeteg hagyományos Pokémon mozdulat és mechanika került átdolgozásra, így például a Protect, a Whirlwind vagy a Toxic Spikes is új szabályok szerint működik.
Az ütközetekben most már nem csak az erőn, hanem a pozíción, az időzítésen és az animációkon is sok múlik. Fontos elem, hogy a támadások hatótávolsága eltérő lehet, ami stratégiai mozgást és előrelátást igényel mindkét féltől. A támadó mozdulatok között megjelennek az erősebb „plus” változatok, amelyek új taktikai lehetőségeket teremtenek.
Felfedezhető vad zónák várják a játékosokat Lumio City különböző pontjain, ahol találkozások, gyógyító kávézók és izgalmas helyszínek váltakoznak, miközben a vertikális tér is szerepet kap. A karakter testreszabásának lehetőségei bővültek, több ruha és kiegészítő választható, mint valaha.
Különös hangsúlyt kapnak a megújult mega evolúciók: időhöz kötött változatban jelennek meg, sőt, bizonyos csaták során több pokémon is egymás után képes mega evolválódni. Az éjszakai ZA Royale bajnokság során a játékosok kihívásokat vállalhatnak külön szekciókban, változatos feladatokkal, amelyek teljesítése után ranglétrán léphetnek feljebb.
A játék kezdetén főhősünk először érkezik Lumio Citybe vonattal, időutazás nélkül. Egyelőre még csak részben ismerhető meg a teljes térkép, de a város sűrűnek, mozgalmasnak ígérkezik – számos aktivitással kecsegtet, amelyek további felfedezésre várnak.