Az utolsó órák eseményei a Resident Evil Village-ben számos meglepő kapcsolódási pontot tárnak fel a franchise korábbi részeihez, különösen a hetedik epizódhoz és az Umbrella vállalat alapításához. A történet során különféle utalások jelennek meg az Umbrella logójára, felvetve a kérdést: milyen összefüggés van egy rejtélyes kelet-európai falu és a világot fenyegető bioterrorista szervezet között?
Kiemelt figyelmet kap Chris Redfield és Ethan Winters kapcsolatának alakulása, valamint az a krimicsomó, amely a Connections nevű árnyékszervezethez és a „mold” nevű titokzatos organizmushoz kapcsolódik. A múltbeli események, például Mia múltja, Evelyn eredete és Miranda tragikus motivációja mind jelentős szerepet kapnak. Európai rejtekhelyek, látomásos tudósok és több évszázados kutatások szövik át a történet szálait.
A szereplők közül Miranda különösen érdekes figura; évszázadokon átívelő kutatásaival és rendkívüli képességeivel erősen befolyásolta Oswell Spencert és az Umbrella irányvonalát. Emellett fontos témává válik a biológiai fegyverkutatás, a személyiség megőrzése, valamint a kollektív tudat kérdése is.
Az események során szó esik a BSAA (Bioterrorism Security Assessment Alliance) működéséről is, és felmerül a kérdés, vajon valóban a jó oldalon állnak-e, amikor furcsa katonákat, sőt, potenciális biológiai fegyvereket küldenek harcba. Miranda, Rose, Heisenberg és Lady Dimitrescu karaktereinek motivációi, valamint a családi kapcsolatok és az emberi identitás kérdésköre tovább árnyalják a történetet.
A végső jelenetek újabb nagy kérdéseket vetnek fel, például a mold természetével, a BSAA valódi céljaival, valamint Rose jövőjével kapcsolatban. A történet számtalan szálon fut tovább, új témákat, rejtélyeket és összetett kapcsolatokat vezetve fel a Resident Evil univerzumában.