Kulcsfontosságú kérdések és titokzatos szálak kerülnek előtérbe, amikor a Game Theory csapata megvizsgálja, mi rejtőzik a Prototype nevű karakter mögött a Poppy Playtime világában. A negyedik fejezet eseményei után rengeteg rajongói teória született, de most új szempontból kerül megvilágításba a történet.
Harley Sawyer múltja, a kísérletek célja és a Bigger Bodies kezdeményezés mind olyan témák, amelyek feszegetik a játék által felvetett erkölcsi és tudományos határokat. Fontos szerepet kap a mesterséges élet megteremtésének és az emberi identitás áthelyezésének kérdése is.
A történetben feltűnő Poppy és a Prototype különlegessége, eredetük feltárása végigkíséri a videót. Az embryológia, a klónozás, valamint a tudatosság átvitelének lehetősége különösen érdekes gondolati síkokra tereli az elemzést, miközben egyre több tudományos és morális dilemmával találkozunk.
A karakterek motivációi ködösek, a titkok kibontásához vezető nyomok pedig múltbeli kutatásokhoz, elfeledett dokumentumokhoz és az emberek játszmáihoz kötődnek. Talán épp ez az összefonódás vezet el egy újfajta evolúció vagy akár az örök élet lehetőségének vizsgálatához.